La chiesa di Santa Marta fu edificata nel 1535 secondo la tipologia a tre navate  propria delle chiese monastiche femminili, caratterizzate da un coro superiore poggiante sui due primi pilastri della navata. Fra il XVII e il XVIII secolo tutta la chiesa fu decorata con pitture e ornati, divenendo luogo di incontro dei migliori frescanti attivi a Genova: vi si possono ammirare infatti opere di G.B. Carlone, Valerio Castello, Domenico Piola, Lorenzo De Ferrari, Paolo Gerolamo Piola e Domenico Parodi.