E’ uno dei capolavori del barocco genovese. L'intero complesso, chiesa e Oratorio ha origine dalla volontà di Camillo Pallavicini, appartenente ai Padri dell'Oratorio (Filippini). La costruzione inizia nel 1673 e ultimata nel 1676.  Il linguaggio del tardo-barocco genovese si esprime oltre che con l'affresco con gli intagli lignei e marmorei, un trionfo di stucchi dorati e dipinti. La prospettiva e gli ornati sono opera di Antonio Maria Haffner, mentre l'affresco della volta con "la Gloria di San Filippo Neri" è di Marcantonio Franceschini. E’ da segnalare la Pietà lignea del Maragliano.

DA SAPERE: A soli 11 anni Niccolò Paganini si esibisce per la prima volta come solista a Genova nella chiesa di San Filippo Neri il 26 maggio 1794.