Il palazzo venne costruito a partire dal 1528 dalla famiglia Querini (Stampalia è il nome dell'isola greca che fu feudo della famiglia fino agli inizi del XVI secolo). Donato alla città dal conte Giovanni Querini nel 1868, ospita la Fondazione omonima caratterizzata da una ricca biblioteca e dalla pinacoteca con importanti opere italiane e straniere provenienti dalla collezione della famiglia e ambientate nel prezioso arredo Settecentesco del Palazzo, in gran parte originale.